门源县在生态环境问题整治过程中，针对县内各水电站存在的环保问题加大整治力度，重点加强对水电站生态基流问题整改情况的跟踪问效，有效保障了水电站生态基流。
一是多措并举保障生态基流。3月初，召集各水电站负责人召开“安装流量在线监控设施协调会”，下发了《关于境内各水电站保证生态基流的通知》和《关于加强水电站生态基流监控值班工作的通知》，安排专人负责生态基流监控工作。同时，为实时有效进行监管，聘用6名生态基流监管员对大通河干流存在生态基流问题的仙米、江源、雪龙滩、玉龙滩、东旭、寺沟口等七座水电站进行实时监督监控，有效解决了生态基流问题。目前，全县28座水电站中13座已安装生态基流监控设备(其中存在生态基流问题的7处已全部安装)，10座正在安装，老虎沟5座水电站目前正在停产整改;石头峡水电站因设计缺陷，已于6月21日安装6台提灌泵保障生态基流，生态基流监控系统已安装完成，永久生态基流保障措施工程可行性研究报告已审查，工程6月24日开工建设，预计2018年6月底完工;仙米水电站委托青海水电设计院正在编制生态基流保障工程可行性研究报告。所有水电站生态基流均已得到保障。
二是创新机制促进问题整改。结合开展浩门河流域非法乱采砂石料问题专项清理整治工作，县委常委会以现场督办的方式，重点对城区饮水安全问题进行了重点督办。目前，全县77处水源地生态环境基础状况调查和饮用水源地生态环境状况评估工作已列入青海省祁连山区山水林田湖生态保护修复试点项目;县水利部门对57处水源地已进行了保护;落实县级财政资金54.18万元，对浩门镇新旧水厂、老虎沟水源地进行了网围栏全封闭保护，安装了老虎沟水源地饮用水源保护区警示牌、标志牌，实现水源地网围栏封禁;投入县级财政资金70.77万元，为浩门水厂配置了消毒和净化设备，同步开展了水质化验监测培训工作。同时，对无取水许可证的元树沟、地久、老虎沟浩华、麻当、梅花、东旭二级、寺沟二级等7座水电站，下发了《关于未办理取水许可手续的水电站停产整顿的通知》;对老虎沟河道内5座水电站，以及麻当、梅花、寺沟二级水电站等共8家未通过竣工环保验收的水电站，下发了责令停止运行的《责令改正违法行为决定书》;对未批先建的雪龙滩附属水电站下发了责令停止运行的《责令改正违法行为决定书》，目前全县共关停整顿水电站12座。
三是跟踪问效解决问题反弹。8月12日，结合生态保护边督边改工作，组织县水利、国土、环林等部门组成联合督查组，对各水电站运行管理和生态基流保障等情况再次进行了专项督查。通过督查，发现元树沟、东旭二级水电站在未取得取水许可证的情况下仍在违规运行，督查组现场依法对两座水电站进行了查封。
