总的来说，风光互补发电系统的效率分别受光伏发电效率、风力发电效率影响，具体来说，风光互补发电系统的输出效率会受到光照强度、灰尘、雨水、风速、太阳高度角和地理纬度、大气透明度和海拔高度、日照时间、温度变化、传动系统、发电机、叶片及其组件的耗损等的影响。
风力发电效率
风力发电系统中影响其发电效率的主要因素有风速、传动系统、发电机、叶片以及控制系统，其中风轮机对风能的利用系数与发电机效率是很重要的影响因素。建设风力发电场的各个地区平均风速不同，也会影响风力发电效率。
光伏发电效率
光伏发电效率是由组成光伏发电系统的各个构件的效率决定的，光伏发电系统需要蓄电池组来保证系统发电的稳定性，而蓄电池组的输出效率主要受到灰尘、雨水、温度变化及其组件的耗损等的影响。自然环境也会影响其效率，影响因素主要包括太阳高度角和地理纬度、大气透明度和海拔高度、日照时间、光照强度等。
风力发电的优点是不消耗任何化石燃料，因而就不会排放二氧化硫（SO2）、二氧化碳（CO2）、甲烷（CH4）、氧化亚氮（N2O）、氢氟碳化合物（HFCs）等有害气体以及温室气体，可以说风能是最清洁且用之不竭的可再生能源。到2010年底，我国首次超过美国，在风力发电累计装机容量上占据了世界第一的位置。据统计，我国累计装机容量达到了4182.7万kW，烟台、威海、潍坊、东营等沿海区域建设了十多个风电场，主要配置了单机容量300kW、600kW、1.25MW、1.5MW、2MW（目前国内最大的单机运行容量）的机型。
在风电机组中，许多设备本身或其某一部分元器件是旋转式运转的，故常因机械损耗或轴承缺陷而产生异常振动，进而发出转动机械产生的噪音，还会由于接触面与附着面间的滑移现象而发出摩擦产生的噪音，而且风电机组本身就是依靠空气流动获得能量，所以空气流动所产生的气动噪音、乱流、喷射流、气蚀、气切、涡流等现象也是难以避免的，空气在高速流经导管或金属表面时碰到阻碍产生乱流或遇到大而急速的压力改变均会产生噪音。
