财政部、国家税务总局《关于调整农业产品增值税税率和若干项目征免增值税的通知》（财税字【1994】004号）规定，对于属于增值税一般纳税人的县以下（含县）小型水力发电单位，可以自行选择17％的税率或6％的征收率缴纳增值税。
优惠政策出台之初，小水电企业几乎都毫不犹豫地选择了6％的征收率。因为小水电几乎不耗用原材料，进项税额抵扣部分很少，而且小水电发电主要是销给农户和村镇小企业，上网售电很少，只要电价便宜，用户也不索取17％的增值税专用发票。但是，2001年农村电网改造结束后，小水电站不能对农户和其他用电企业直接供电，必须将电售给大电网，再由电力部门统一将电卖给用户。电网公司在收购小水电的电量时，要索取17％的增值税专用发票，作为它们的进项抵扣。结果小水电企业为了将电卖出去，纷纷转向选择17％的税率。这时继续选择6％的征收率比选择17％的税率更吃亏。因为，选择17％的税率，每年还有一部分进项税额可以抵扣；如果选择6％的税率，买电的电网公司在下一个销售环节时，也将只能抵扣6％，却要缴纳17％，电网公司显然不愿多承担11％的销项增值税，所以必然要向小水电企业压价11％，那样小水电企业的实际负担仍达到17％，还不能抵扣进项税额，更不划算。
在现实情况下，可以自主选择增值税税率的小水电企业，却步调一致地选择了就高不就低，这显然是违背常理的。税收优惠在现实中缩水，成为了看上去很美的政策摆设，显然，有关部门应该反思，相关税收优惠政策是否在某些环节需要进一步完善了？
